多序列比对

蛋白质指纹序列图谱是基于多序列比对的结果，它由比对结果得到一系列相当保守的序列模体构建而成，用来表示蛋白质家族特征的图谱。蛋白指纹图谱技术是由蛋白质芯片及分析仪器-表面加强激光解析电离飞行时间质谱两部分组成，可以将病人血清中蛋白质成分的变化记录下来，绘制成蛋白指纹质谱图，并显示样品中各种蛋白的分子量、含量等信息。

蛋白质序列指纹图谱基于多序列比对的结果，它由比对结果得到一系列相当保守的序列模体构建而成，用来表示蛋白质家族特征。蛋白指纹图谱技术是由蛋白质芯片及分析仪器—表面加强激光解析电离飞行时间质谱两部分组成，可以将病人血清中蛋白质成分的变化记录下来，绘制成蛋白指纹质谱图，并显示样品中各种蛋白的分子量、含量等信息。通过这项技术，将来人们有可能拥有自己的生命光盘，记录下个人有生以来不同阶段的蛋白指纹图谱，从分子水平了解并观察自己的生理变化，或作为治疗前后的比对参照。蛋白指纹图谱和蛋白质芯片是继基因芯片技术之后新一代生物芯片技术，蛋白指纹图谱技术（本技术在国内已获得蛋白指纹法专利：用于生物样品分析的蛋白指纹法，专利号ZL 03148375.5, 发明人： 许洋）被国际顶级科学杂志《科学》以及医学界权威杂志《柳叶刀》评为世界蛋白指纹图谱和蛋白质芯片排名第一的技术。其专利蛋白指纹图谱技术最大优点是快速、简便

把两个以上字符序列对齐，逐列比较其字符的异同，使得每一列的字符尽可能一致，以发现其共同的结构特征的方法称为多序列比对。多序列比对问题是双序列比对问题的推广。多序列比对的目标是使得参与比对的序列中有尽可能多的列具有相同的字符，即，使得相同残基的位点位于同一列，这样以便于发现不同的序列之间的相似部分，从而推断它们在结构和功能上的相似关系，主要用于分子进化关系，预测蛋白质的二级结构和三级结构、估计蛋白质折叠类型的总数，基因组序列分析等。